Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SF3A1Q15459 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A1Q15459 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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