Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRRQ15256 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRRQ15256 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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