Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLD3Q15054 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD3Q15054 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD3Q15054 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD3Q15054 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD3Q15054 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD3Q15054 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD3Q15054 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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