Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP1Q15042 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP1Q15042 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
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