Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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