Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPHQ15003 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPHQ15003 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPHQ15003 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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