Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSPNQ14714 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSPNQ14714 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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