Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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RBM39Q14498 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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RBM39Q14498 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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