Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA1SQ13698 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
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