Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CUL4AQ13619 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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