Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRQ13535 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATRQ13535 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATRQ13535 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRQ13535 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRQ13535 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRQ13535 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRQ13535 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRQ13535 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRQ13535 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRQ13535 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRQ13535 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRQ13535 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRQ13535 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRQ13535 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATRQ13535 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATRQ13535 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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