Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF4BQ13523 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF4BQ13523 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF4BQ13523 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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