Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPP1R1AQ13522 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms