Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAD4Q13485 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms