Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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