Protein–RNA interactions for Protein: Q13277

STX3, Syntaxin-3, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX3Q13277 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX3Q13277 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STX3Q13277 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STX3Q13277 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX3Q13277 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX3Q13277 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STX3Q13277 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX3Q13277 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STX3Q13277 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX3Q13277 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX3Q13277 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX3Q13277 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX3Q13277 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
STX3Q13277 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX3Q13277 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX3Q13277 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX3Q13277 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX3Q13277 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX3Q13277 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX3Q13277 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX3Q13277 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX3Q13277 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX3Q13277 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX3Q13277 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX3Q13277 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX3Q13277 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX3Q13277 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX3Q13277 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX3Q13277 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX3Q13277 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX3Q13277 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX3Q13277 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX3Q13277 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX3Q13277 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX3Q13277 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX3Q13277 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX3Q13277 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
STX3Q13277 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX3Q13277 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX3Q13277 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX3Q13277 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX3Q13277 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX3Q13277 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX3Q13277 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX3Q13277 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX3Q13277 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX3Q13277 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX3Q13277 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX3Q13277 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX3Q13277 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX3Q13277 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX3Q13277 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX3Q13277 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX3Q13277 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX3Q13277 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX3Q13277 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
STX3Q13277 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX3Q13277 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX3Q13277 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
STX3Q13277 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX3Q13277 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX3Q13277 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX3Q13277 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX3Q13277 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX3Q13277 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
STX3Q13277 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX3Q13277 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX3Q13277 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX3Q13277 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX3Q13277 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX3Q13277 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX3Q13277 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX3Q13277 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms