Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3BQ13214 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms