Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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