Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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IFT88Q13099 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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IFT88Q13099 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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IFT88Q13099 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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IFT88Q13099 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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IFT88Q13099 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT88Q13099 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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