Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC16Q13042 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms