Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ECH1Q13011 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ECH1Q13011 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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