Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYCNQ0VAF6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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