Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RIPPLY1Q0D2K3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIPPLY1Q0D2K3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms