Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM27E3Q08E93 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms