Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A11Q08AI6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms