Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 PSE1YMR308C 3270 nt5.07□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 PCL8YPL219W 1479 nt5.07□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 UBP8YMR223W 1416 nt5.06□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 TRM13YOL125W 1431 nt5.06□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 DBP5YOR046C 1449 nt5.06□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 TOS3YGL179C 1683 nt5.06□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YCR015CYCR015C 954 nt5.06□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt5.06□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YLR462WYLR462W 609 nt5.06□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 PML39YML107C 1005 nt5.06□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 SPS19YNL202W 879 nt5.06□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 RPB8YOR224C 441 nt5.06□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 ASK10YGR097W 3441 nt5.06□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 TRM1YDR120C 1713 nt5.06□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YEH2YLR020C 1617 nt5.05□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 MPH2YDL247W 1830 nt5.05□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 ZRT1YGL255W 1131 nt5.05□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 GPN3YLR243W 819 nt5.05□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 SEC72YLR292C 582 nt5.05□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 ROT1YMR200W 771 nt5.05□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 PNT1YOR266W 1272 nt5.05□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 RMI1YPL024W 726 nt5.05□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 RPL21BYPL079W 483 nt5.05□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 ARO4YBR249C 1113 nt5.05□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 DOA1YKL213C 2148 nt5.05□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YAP1802YGR241C 1707 nt5.04□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YDL109CYDL109C 1944 nt5.04□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 CAF4YKR036C 1932 nt5.04□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YFR057WYFR057W 456 nt5.04□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YGL230CYGL230C 444 nt5.04□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 SPL2YHR136C 447 nt5.04□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 RFC2YJR068W 1062 nt5.04□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 EAF7YNL136W 1278 nt5.04□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 PNO1YOR145C 825 nt5.04□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 TMA16YOR252W 537 nt5.04□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 GGA1YDR358W 1674 nt5.04□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 UGA1YGR019W 1416 nt5.04□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 NSG1YHR133C 876 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 PSF2YJL072C 642 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 SMD2YLR275W 333 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YBL010CYBL010C 843 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 RFM1YOR279C 933 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 PDX3YBR035C 687 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 FDH1YOR388C 1131 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 GRE1YPL223C 507 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 VMA13YPR036W 1437 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 SEO1YAL067C 1782 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 TDA7YNL176C 1911 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 PMT5YDL093W 2232 nt5.03□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 CTS1YLR286C 1689 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 YDL124WYDL124W 939 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 DET1YDR051C 1005 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 NBP2YDR162C 711 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 NAG1YGR031C-A 492 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 BTN2YGR142W 1233 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 LNP1YHR192W 837 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 SAS5YOR213C 747 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 SHE3YBR130C 1278 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 UMP1YBR173C 447 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 MEC3YLR288C 1425 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 STE20YHL007C 2820 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 RIM15YFL033C 5313 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 QDR1YIL120W 1692 nt5.02□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 ERG4YGL012W 1422 nt5.01□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 CTH1YDR151C 978 nt5.01□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 YGL088WYGL088W 366 nt5.01□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt5.01□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 RFA3YJL173C 369 nt5.01□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 RCN1YKL159C 636 nt5.01□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 GSP1YLR293C 660 nt5.01□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 CPR3YML078W 549 nt5.01□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 RRG9YNL213C 645 nt5.01□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 CUE5YOR042W 1236 nt5.01□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 CLF1YLR117C 2064 nt5.01□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 MOT2YER068W 1764 nt5.01□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 GDB1YPR184W 4611 nt5□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 GAS3YMR215W 1575 nt5□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 SER3YER081W 1410 nt5□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 AAD4YDL243C 990 nt5□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 YFL019CYFL019C 354 nt5□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 YGR079WYGR079W 1113 nt5□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 CYC2YOR037W 1101 nt5□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 UFE1YOR075W 1041 nt5□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 HUA2YOR284W 732 nt5□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 YBR219CYBR219C 384 nt5□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 GAS5YOL030W 1455 nt5□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 EUG1YDR518W 1554 nt4.99□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 KIP2YPL155C 2121 nt4.99□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 KIN28YDL108W 921 nt4.99□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 AIR2YDL175C 1035 nt4.99□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 RAD55YDR076W 1221 nt4.99□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt4.99□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 ERJ5YFR041C 888 nt4.99□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 YKR051WYKR051W 1257 nt4.99□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 YAR023CYAR023C 540 nt4.99□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 USB1YLR132C 873 nt4.99□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 SHE1YBL031W 1017 nt4.99□□□□□ -1.61
SGO1Q08490 TPP1YMR156C 717 nt4.99□□□□□ -1.61
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