Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LOXL1Q08397 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL1Q08397 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms