Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 PBN1YCL052C 1251 nt6.9□□□□□ -1.3
BUD20Q08004 AFG2YLR397C 2343 nt6.9□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 PHO5YBR093C 1404 nt6.9□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 GYP8YFL027C 1494 nt6.9□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 ARP4YJL081C 1470 nt6.9□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YJL163CYJL163C 1668 nt6.9□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 HXT3YDR345C 1704 nt6.9□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 FRE7YOL152W 1863 nt6.9□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YIL108WYIL108W 2091 nt6.89□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 NUS1YDL193W 1128 nt6.89□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 MRPL7YDR237W 879 nt6.89□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 SDT1YGL224C 843 nt6.89□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YGR073CYGR073C 372 nt6.89□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 CIA2YHR122W 696 nt6.89□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 PET130YJL023C 1044 nt6.89□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 GEP5YLR091W 882 nt6.89□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 GIM5YML094W 492 nt6.89□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YMR099CYMR099C 894 nt6.89□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 RPL15BYMR121C 615 nt6.89□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 CUE2YKL090W 1332 nt6.89□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 PES4YFR023W 1836 nt6.88□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 ECM7YLR443W 1347 nt6.88□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 GRX3YDR098C 858 nt6.88□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YER068C-AYER068C-A 432 nt6.88□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 RPT6YGL048C 1218 nt6.88□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YLR125WYLR125W 411 nt6.88□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 APS1YLR170C 471 nt6.88□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 RPA49YNL248C 1248 nt6.88□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YOL046CYOL046C 675 nt6.88□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 CTF19YPL018W 1110 nt6.88□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 FCP1YMR277W 2199 nt6.88□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 AMN1YBR158W 1650 nt6.87□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 SNU56YDR240C 1479 nt6.87□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt6.87□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt6.87□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt6.87□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YCL020WYCL020W 1317 nt6.87□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt6.87□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 SPT2YER161C 1002 nt6.87□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt6.87□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 SPE3YPR069C 882 nt6.87□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 MRPL27YBR282W 441 nt6.87□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 ADY3YDL239C 2373 nt6.87□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 PYK2YOR347C 1521 nt6.86□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 SRF1YDL133W 1314 nt6.86□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 ERS1YCR075C 783 nt6.86□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt6.86□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 VPS61YDR136C 573 nt6.86□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 TMA20YER007C-A 546 nt6.86□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 VPS51YKR020W 495 nt6.86□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YBL010CYBL010C 843 nt6.86□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 SYC1YOR179C 567 nt6.86□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 FIT2YOR382W 462 nt6.86□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 ECM33YBR078W 1290 nt6.86□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 BIO3YNR058W 1443 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 MPH3YJR160C 1809 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YMR111CYMR111C 1389 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 VBA5YKR105C 1749 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 MRPL28YDR462W 444 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 FAU1YER183C 636 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 PAC10YGR078C 600 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YHR138CYHR138C 345 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 PCL7YIL050W 858 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 RPL31BYLR406C 342 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 MED7YOL135C 669 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 ECM31YBR176W 939 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 MSN4YKL062W 1893 nt6.85□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 SIR1YKR101W 1965 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 HEM1YDR232W 1647 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 MRPS28YDR337W 861 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 SLD5YDR489W 885 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 LSB1YGR136W 726 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 MTR3YGR158C 753 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 YJL144WYJL144W 315 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 SOP4YJL192C 705 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 SRP40YKR092C 1221 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 TOM22YNL131W 459 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 MAP2YBL091C 1266 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 VMA4YOR332W 702 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 ICP55YER078C 1536 nt6.84□□□□□ -1.31
BUD20Q08004 MIC60YKR016W 1623 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 GUP2YPL189W 1830 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 TUF1YOR187W 1314 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 PAP2YOL115W 1755 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 UGO1YDR470C 1509 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 UBC9YDL064W 474 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 HHY1YEL059W 309 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YER087C-AYER087C-A 552 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YER158W-AYER158W-A 216 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YGL102CYGL102C 429 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 MAM33YIL070C 801 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YIL175WYIL175W 318 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 HOC1YJR075W 1191 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 LDB7YBL006C 543 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 ICY2YPL250C 411 nt6.83□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 RPN4YDL020C 1596 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 AGP2YBR132C 1791 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 MSC3YLR219W 2187 nt6.82□□□□□ -1.32
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