Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms