Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABPAQ06546 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABPAQ06546 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms