Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms