Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKCZQ05513 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms