Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE3AQ05086 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms