Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1Q04771 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1Q04771 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACVR1Q04771 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms