Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX2Q04743 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms