Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF85Q03923 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF85Q03923 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF85Q03923 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF85Q03923 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF85Q03923 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms