Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
ERCC6Q03468 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms