Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms