Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSG1Q02413 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms