Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms