Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
XPCQ01831 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
XPCQ01831 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
XPCQ01831 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
XPCQ01831 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
XPCQ01831 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
XPCQ01831 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
XPCQ01831 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
XPCQ01831 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
XPCQ01831 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
XPCQ01831 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
XPCQ01831 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
XPCQ01831 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
XPCQ01831 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
XPCQ01831 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
XPCQ01831 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
XPCQ01831 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
XPCQ01831 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
XPCQ01831 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
XPCQ01831 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
XPCQ01831 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
XPCQ01831 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
XPCQ01831 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
XPCQ01831 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
XPCQ01831 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
XPCQ01831 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
XPCQ01831 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
XPCQ01831 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
XPCQ01831 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
XPCQ01831 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
XPCQ01831 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
XPCQ01831 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
XPCQ01831 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
XPCQ01831 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
XPCQ01831 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
XPCQ01831 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
XPCQ01831 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
XPCQ01831 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
XPCQ01831 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
XPCQ01831 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
XPCQ01831 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
XPCQ01831 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
XPCQ01831 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
XPCQ01831 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
XPCQ01831 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
XPCQ01831 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
XPCQ01831 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
XPCQ01831 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
XPCQ01831 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
XPCQ01831 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
XPCQ01831 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
XPCQ01831 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
XPCQ01831 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
XPCQ01831 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
XPCQ01831 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
XPCQ01831 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
XPCQ01831 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
XPCQ01831 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
XPCQ01831 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
XPCQ01831 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
XPCQ01831 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
XPCQ01831 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
XPCQ01831 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
XPCQ01831 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
XPCQ01831 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
XPCQ01831 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
XPCQ01831 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
XPCQ01831 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
XPCQ01831 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
XPCQ01831 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
XPCQ01831 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
XPCQ01831 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
XPCQ01831 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
XPCQ01831 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
XPCQ01831 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
XPCQ01831 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
XPCQ01831 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
XPCQ01831 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
XPCQ01831 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
XPCQ01831 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
XPCQ01831 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
XPCQ01831 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
XPCQ01831 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
XPCQ01831 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
XPCQ01831 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
XPCQ01831 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
XPCQ01831 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
XPCQ01831 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
XPCQ01831 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
XPCQ01831 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
XPCQ01831 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
XPCQ01831 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
XPCQ01831 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
XPCQ01831 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
XPCQ01831 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
XPCQ01831 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
XPCQ01831 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
XPCQ01831 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
XPCQ01831 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
XPCQ01831 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms