Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MC1RQ01726 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms