Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFITM3Q01628 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms