Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXK2Q01167 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXK2Q01167 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXK2Q01167 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXK2Q01167 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXK2Q01167 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXK2Q01167 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms