Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms