Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2P78314 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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