Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPEP62304 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms