Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2HP62256 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms