Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TMEM258P61165 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TMEM258P61165 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TMEM258P61165 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TMEM258P61165 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TMEM258P61165 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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