Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDL3P58872 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms